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管理类学院
继续教育学院 船山学院 国际学院 (与国际交流与合作处/港澳台事务办公室合署办公,不设专职人员)
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理工科类学院
机械工程学院 电气工程学院 核科学技术学院 资源环境与安全工程学院 计算机学院/软件学院 土木工程学院 化学化工学院 数理学院
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人文社科类学院
松霖建筑与设计艺术学院 经济管理与法学学院 语言文学学院 马克思主义学院 体育学院
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衡阳医学院
基础医学院 药学院 公共卫生学院 护理学院 实验动物学部 附属第一医院/第一临床学院 附属第二医院/第二临床学院 附属第三医院 附属南华医院/南华临床学院 附属长沙中心医院/ 长沙中心医院临床学院 南华大学附属妇幼保健院(湖南省妇幼保健院) 附属公共卫生医院 南华大学附属第七医院